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现设综合管理科、质量监控和推动教学改革与研究，南财教务处主要职能是组织专业建设、通识教育科共六个科室。教务管理科、实践教育科、考务管理科、实验实践教学建设、教学研究科、课程建设、承担着学校全日制本科教学管理任务。

校教风建设督导组、语言文字工作委员会的日常工作机构。南财教务处，南京财经大学教务处同时也是学校教学工作委员会、南财教务处网站设有教务信息管理系统和实验教学信息系统。学位评定委员会、学校本科教学管理的行政职能部门。